Esta zona toma su nombre de una antigua leyenda que cuenta cómo se trajeron hasta aquí desde Constantinopla los restos del Santo, que más tarde los enterraron en la capilla construida por la Orden de San Agustín en 1028. En el siglo XV los agustinos fueron sucedidos por los benedictinos, quienes, en 1439, construyeron el convento y la iglesia que todavía pueden verse hoy en día.
El complejo religioso se desacralizó en 1810 para usarlo con fines militares durante más de un siglo. En 1930 se volvió a utilizar como iglesia y el convento pasó a manos de las monjas Mantellate. Se convirtió primero en una institución educativa privada y después en un lugar de alojamiento para creyentes y peregrinos en su viaje a Venecia.
En 1999, cuando las monjas decidieron abandonar el lugar, el edificio fue sometido a un largo trabajo de restauración que llevó a la creación de Hotel Indigo Venecia - Sant'Elena. No obstante, se han conservado las características distintivas y el carácter histórico del edificio, así como la eterna fachada, el interior del pórtico y el jardín que, en su día, fue el claustro.
